3 万宏基因组研究解释人体肠道与地域、健康与遗传结构的深度关联
为探究肠道微生物种内遗传变异与宿主健康的关系，研究人员分析 32152 个全球样本的宏基因组。发现菌株地理分层与水平传播有关，微生物系统发育与多种人类表型相关。这有助于理解肠道微生物对健康的影响。
基因组
Nature：单个核小体如何塑造3D基因组结构
为探究单个核小体是否蕴含3D基因组结构信息，研究人员开展相关研究。他们发现核小体的凝聚性与基因表达及A/B区室化紧密相关，这一成果为了解基因组结构形成提供关键线索，有助于深入研究细胞分化、疾病发生等过程。
南京大学联合南京农大开发基于719个植物基因组的比较系统发育基因组学综合数据库
近日，Plant Biotechnology Journal杂志在线发表了由南京大学陈迪俊团队、邵珠卿团队以及南京农业大学薛佳宇团队合作撰写的研究论文，题为“PGCP: A comprehensive database of plant genomes for
中国水产科学研究院黄海所破译鳀染色体水平基因组
近日，中国水产科学研究院黄海水产研究所海洋渔业资源分子生态学研究团队成功破译了鳀（Engraulis japonicus）染色体水平基因组，成果以“Chromosome-level genome assembly and annotation of Japan
高精度全基因组选择AI平台
全基因组选择育种技术可在早期高效预测个体表现，助力精准选种与优质亲本组合设计, 有没有一款对育种群体操作简易的零门槛产品，保护数据隐私的同时用户只需选择数据即可分析预测？
石榴基因组研究取得重大突破，多项遗传机制被揭示
近日，中国农业科学院郑州果树研究所特色浆果与干果种质改良课题组取得了一项令人瞩目的科研成果。他们成功组装出首个石榴端粒到端粒参考基因组图，这一突破性进展在石榴研究领域具有里程碑意义，相关成果发表于国际知名期刊《植物生物技术杂志》（Plant Biotechno
濒临灭绝的北方白犀牛的基因组为该物种的复兴带来了希望
北方白犀牛是地球上最稀有的动物之一，只剩下两只雌性，而且该物种没有自然繁殖的方式。现在，来自斯克里普斯研究中心、圣地亚哥动物园野生动物联盟、马克斯普朗克分子遗传学研究所和其他合作者的国际科学家团队已经绘制了北白犀牛的整个基因组图谱。这代表着利用先进的生殖技术将
微生物组-宏基因组分析专题技术研讨会(2025.11)
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S、宏基因组、临床基因组和转录组分析专题技术研讨会线上直播和线下面授相结合。报名参加线上直播课，可以随时开通视频课题自学，同时老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课。期待和大
中国全基因组关联研究的当前热点和未来发展方向：DeepSeek联合大数据分析
功能验证与机制解析：通过整合表观基因组（如ATAC-seq、ChIP-seq）、转录组（eQTL、scRNA-seq）、蛋白质组（pQTL）和代谢组数据，定位因果变异并揭示生物学机制。例如，通过CRISPR筛选验证候选基因功能。
单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源(2025.5)
福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、单物种转录组、单菌基因组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 。期待和大家的线上线下会晤。
Microbiome | 当代微生物组研究的蓝图
2025年4月8日，比利时布鲁塞尔鲁汶天主教大学Laure B. Bindels等在Microbiome发表了题为 ‘A blueprint for contemporary studies of microbiomes’ 的论文。这篇社论由Microbiom
研究 微生物 基因组 测序 microbiome 2025-05-16 11:37 10
一种“金属探测器”算法可以追踪脆弱的肿瘤
瘤的识别和治疗方式，这在癌症治疗领域取得了突破性的进展。这项名为PRRDetect的创新算法，其工作原理类似于“金属探测器”，能够发现存在DNA缺陷的肿瘤，从而提高其对治疗的敏感性。
尿路上皮癌不同组织学亚型的手术结局及基因组差异
尿路上皮癌（UC）人群的分化程度及组织学亚型存在一定差异；然而，其基因组变异及各亚型的致癌驱动因素尚不明确。近期，一项美国研究对组织学异常的尿路上皮癌（UCAH）的手术结局及基因组差异进行分析，发现浆细胞样、微乳头状、肉瘤样或混合组织学类型的肿瘤患者的癌症特异
ASCO首次发布转移性前列腺癌的胚系和体细胞基因组检测指南
前列腺癌是全球男性健康的重要威胁，也是导致疾病负担的主要原因之一。与许多其他肿瘤一样，体细胞基因组检测具有改善预后和预测能力，并可能影响转移性前列腺癌患者的治疗决策。胚系基因检测也能提供类似的信息，并且还有可能为家庭成员提供额外的遗传性癌症风险，告知他们前列腺
图形泛基因组为苹果精准育种“加码”
然而，中国工程院院士、中国农业科学院作物科学研究所研究员刘旭指出，当前我国苹果种业面临优异种质资源匮乏、核心性状改良周期长、现代分子技术应用不足等瓶颈问题，严重制约了苹果新品种的选育及产业的持续提质增效。
登上《柳叶刀》子刊！迪谱诊断基于纳米孔宏基因组测序最新研究成果顺利发表
肺炎诊治的核心环节是病原学诊断。传统检测手段，如培养法，耗时长、阳性检出率低，且难以检测病毒与非典型病原体；而血清学方法、基因芯片和PCR技术仅能在极小范围内检出一种或数种病原，存在一定“盲区”。宏基因组二代测序（mNGS）虽能突破上述缺点，但其读长较短，不能
Nat. Commun. | 首个作物全基因组多靶向CRISPR文库，破解多基因功能冗余研究难题
遗传变异对育种计划和突变体筛选至关重要，但传统诱变方法受限于基因冗余和靶向特异性不足。CRISPR-Cas9虽能实现精准基因编辑，但在作物改良中的规模化应用仍面临挑战。本研究在番茄中构建了全基因组多靶向CRISPR文库，通过设计15,804个独特单导RNA（s
奎斯特诊断诊断申请基因组测序选择系统专利，能计算测序统计
国家知识产权局信息显示，奎斯特诊断投资有限责任公司申请一项名为“基因组测序选择系统”的专利，公开号CN119905142A，申请日期为2019年10月。
探索难以触及的DNA禁区
了解人类DNA在数代人之间的变化情况，对于评估遗传疾病风险及理解人类的进化机制至关重要。 据估计，每个人的基因组中大约有200个新的基因变异，而这些变异在父母的基因组中并不存在。过去的研究发现，其中很多这样的变化发生在一些难以测序的DNA区域。
Nature | 新发现转录因子及其调节基因的“混乱生活”
一项近日发表在Nature的工作通过在酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）综合系统地分析近乎所有转录相关因子与DNA的结合（主要基于ChEC-seq[1]），及其靶向调节基因（通过degron系统快速降解转录因子来分析其直接调节基因[2
基因 转录 基因组 doi transcription 2025-04-23 00:02 12